משנת תנאים הוא מפעל ייחודי להוצאתה מחדש של התוספתא – החיבור הקדום ביותר סביב המשניות, מתקופת התנאים – באופן תמציתי ובהיר, בנוסח שימושי־לימודי המשלב בין מסורתיות ומדעיות. מהדורת משנת תנאים מבוססת על עבודתו הגדולה והיסודית של הרב דן בארי שההדיר את הנוסח, וחידושה המרכזי הוא שילוב התוספתא עם המשניות: מסכתות המשנה והתוספתא מובאות תמיד בשלמותן וכסדרן , אך בהתאמה מרבית בין שני החיבורים. מעלה נוספת של משנת תנאים היא הנגשת הנוסחים המופיעים בכתבי יד עתיקים ומרכזיים: המשנה מובאת על פי כתב יד קויפמן, והתוספתא מבוססת על כתב יד וינה עם תיקוני הרב פרופ’ שאול ליברמן. שני החיבורים מנוקדים במהדורה זו על פי מסורת ההגייה הייחודית בארץ ישראל בתקופת התנאים. משנת תנאים מביאה את הנוסחים בסידור נקי ובהיר, כמעט ללא הערות פרשנות וחילופי גרסאות. עם זאת, היא כוללת גם מעט הערות מבארות למילים קשות שמקורן בשפות אחרות, וכן הפניות רבות להגהותיו החשובות של הגאון מווילנה, כולל ציון המקבילות שעליהן הסתמך. הלימוד במהדורה מעניק עומק וחוויה חדשים ללימוד כתבי היסוד של תורה שבעל פה: המשנה והתלמוד, וכמובן התוספתא עצמה שעד כה נשכחה בקרן זווית, וכעת זוכה להוצאה מהודרת ונוחה. עד כה יצאו שלושה כרכים – על הסדרים זרעים, מועד ונשים.